Le sud et le centre du Mali sont irrigués par deux fleuves : le Sénégal, ainsi que le Niger.

Trois zones climatiques se succèdent du nord au sud :
- le Nord appartient à la zone saharienne chaude, ensoleillée et aride.
- le delta intérieur du Niger s’étend dans la zone sahélienne semi-aride.
- enfin, le Sud connaît un climat soudanien.

Le climat malien se caractérise par trois saisons tout au long de l'année :
- une saison sèche dont la durée varie du Nord au sud, de Mars à Juin
- une saison humide(hivernage) de Juin à Septembre
- une intersaison caractérisée par sa fraîcheur, d'Octobre à Février.

L'amplitude thermique annuelle varie d'environ 24° c au mois de Janvier et d'environ 35° c au mois de Mai et sont plus élevées dans le nord du pays.

Les précipitations annuelles varient d’environ 1 120 mm à Bamako à moins de 127 mm dans le Sahara.